İlk yarıyı yenilgisiz kapatan Beşiktaş, ikinci yarıda yaptığı 15 maçta tam 6 kez sahadan yenik ayrılıp, 4 kez de eşitliği bozamayınca, yalnızca 5 kez 3 puan alıp, toplam 26 puan yitirdi. Ligin ikinci yarısında toplam 23 gol atıp, kalesinde 27 gol gören Beşiktaş, lider Fenerbahçe'nin 1 maç eksiğiyle 8, 2. sıradaki Trabzonspor'un ise yine 1 maç eksiğiyle 6 puan gerisinde 3. sırada kaldı.

Beşiktaş tarihine kara harflerle geçen 2003-2004 sezonunun 2. yarısında siyah-beyazlı takımın yaptığı maçlarda aldığı sonuçlar şöyle:

Beşiktaş-Samsunspor: 0-4 (Hükmen).
Bursaspor-Beşiktaş: 0-1.
Ankaragücü-Beşiktaş: 1-1.
Beşiktaş-Denizlispor: 3-1.
Malatyaspor-Beşiktaş: 0-0.
Beşiktaş-İstanbulspor: 1-2 (İzmit'te oynandı).
Trabzonspor-Beşiktaş: 3-0.
Beşiktaş-Elazığspor: 5-3.
Diyarbakırspor-Beşiktaş: 3-1.
Beşiktaş-Gaziantepspor: 4-1.
Galatasaray-Beşiktaş: 1-2.
Beşiktaş-Gençlerbirliği: 2-2.
Konyaspor-Beşiktaş: 2-2.
Beşiktaş-Fenerbahçe: 1-3.
Adanaspor-Beşiktaş: 1-0.