29 yaşındaki Jancker, Rostock, Köln ve Rapid Wien'de dikkatleri çektikten sonra 1996'da Bayern Münih'e geldi. 1.93'lük Jancker, hava hakimiyeti ve golcülüğüyle Alman Milli Takımı'na seçildi. 33 milli maçta 10 gol kaydetti. Bayern formasıyla 6 sezonda 48 lig ve 19 Şampiyonlar Ligi golü atan Jancker, geçen sezon Udinese'ye transfer oldu. İtalya'da bekleneni veremeyen tecrübeli futbolcu geçen sezon 1 golde kalırken bu sezon 4 maçta da rakip fileleri havalandıramadı.