Feyenoord karşısında takımının ilk golünü atan Mustafa Pektemek, 5 gol bulduğu hazırlık maçları sonrasında bunun tesadüf olmadığını gösterdi.

Beşiktaş’a 2011-2012’de transfer olan golcü, 30 lig mücadelesinde sahaya çıktı, 8 kez rakip fileleri  havalandırdı. Tecrübeli futbolcu, 7 kez de UEFA Avrupa Ligi’nde görev aldı. Takımının Stoke City ile yaptığı ve 3-1 kazandığı karşılaşmada Mustafa 1 gol  sevinci yaşadı. Ancak son iki sezondaki en büyük kâbusu sakatlıklar oldu.

2012-2013’te ilk iki maçta forma giyen siyah-beyazlı oyuncu, ilk  yarının kalan karşılaşmalarında sakatlığı nedeniyle yer alamadı. İkinci yarıda bu nedenle 8 mücadeleyi kaçıran tecrübeli golcü, Süper Lig’de toplamda 9 maçta görev alabildi ve 2 gol attı. Mustafa, geçen sezon da 22 lig maçında 3 gol atabilmişti.