Takımla 21 Temmuz 2005'te, son yılı opsiyonlu olmak üzere toplam 3 yıllık sözleşme imzalayan Ailton, 188 günlük Beşiktaş serüveninde, Turkcell Süper Ligi'nde 14, UEFA Kupası'nda ise 4 kez sahaya çıktı.

Ligdeki 14 maçın 7'sinde sahada 90 dakika kalan Brezilyalı futbolcu, toplam 1006 dakika forma giydi ve 5 gole imza attı.

UEFA Kupası'nda bu sezon oynanan 8 maçın 4'ünde görev alan ve 281 dakika sahada kalan Ailton, 2 kez rakip fileleri havalandırdı.

Turkcell Süper Ligi'nde 2 sarı, 1 de kırmızı kartla cezalandırılan Ailton, cezası nedeniyle 2 maçta takımındaki yerini alamadı.